我院柑橘种质创新与利用团队在柑橘指纹图谱和分子身份证方面取得新进展

近日，我院柑橘种质创新与利用团队在二区期刊《horticulture》（IF=3.0）发表题为“Fluorescent SSR Based DNA Fingerprinting and Molecular Identity Card Development for 69 Mandarin Accessions”的研究论文。

为了建立标准化宽皮柑橘DNA指纹与分子鉴定体系，本研究利用荧光SSR毛细管电泳技术对69份宽皮柑橘种质资源进行了分析，构建了其DNA分子指纹及分子身份证。筛选出18对高多态性SSR引物，共获得239个基因型数据和147个等位基因。每对引物扩增的等位基因数量为4至18个，多态性信息含量（PIC）介于0.411至0.650之间。进一步筛选出10对核心引物，其品种区分率达65.2%（即69份种质中有45份可被区分）。利用上述荧光SSR标记，成功构建了全部69份种质的DNA分子指纹图谱和分子身份证。其中，45份种质具有独特的指纹图谱。本研究为宽皮柑橘种质资源的鉴定、保护及遗传关系分析提供了实用基础，并为规范宽皮柑橘的品种鉴定建立了技术框架。

图1 指纹图谱的构建

本研究仍存在局限性。未来的工作将针对这些局限性，通过以下方式加以改进：（1）扩大种质资源范围，纳入更多野生和栽培宽皮柑橘种质，建立全面的分子身份证数据库；（2）整合先进技术（如转座子展示、靶向SSR测序和全基因组测序），提高对芽变品种的区分能力；（3）在多环境、多年度的试验中对已开发的分子身份证进行验证，以增强其在品种实际鉴定中的可靠性；（4）将分子身份证与表型性状相结合，解决柑橘命名冲突问题，并厘清遗传关系。这些努力将推动宽皮柑橘种质资源管理，支持知识产权保护，并促进柑橘产业的可持续发展。 

图2 分子身份证结果

广西特色作物研究院武晓晓高级农艺师为论文的第一作者，邓崇岭研究员为通讯作者，陈传武、方海猛、娄兵海、刘萍等参与了研究。该研究得到了国家自然科学基金（U23A20198）、广西柑橘创新团队（nycytxgxcxtd-2021-05）、广西特色作物试验总站（TS202101）等项目的资助。 

（武晓晓 文/图）